肠道病毒71型是引起婴幼儿手足口病(hand - foot and mouth disease;HFMD)主要病原体之一。手足口病是由一组肠道病毒感染引起的急性传染病。有许多致病性病毒。EV71就是其中之一，叫做肠道病毒71。通常引起手足口病，严重手足口病多来自EV71病毒感染。

患儿感染肠道病毒EV71后，多以发热起病，一般为38℃左右，发热同时在口腔、手足、臀部出现皮疹，或出现口腔粘膜疱疹。部分病人早期有咳嗽等感冒样表现。发热1～2天后开始出现皮疹，通常出现在手掌和足底，也可以出现在臀部。有的患儿不发热，只表现为手、足、臀部皮疹或疱疹性咽峡炎，病情较轻。大多数患儿在一周以内体温下降、皮疹消退，病情恢复。少数患者可出现脑炎及脑脊髓炎、肺水肿、循环衰竭等，严重时可危及生命。